대통령 선출 논란이 한달여를 넘기며 장기화되면서 부시의 차기행정부 정권 인수 작업이 상당한 어려움을 겪을 전망이다.

새 행정부가 정권 인수 작업을 벌일 수 있는 기간은 보통 10주 가량 되지만 구체적인 작업없이 이미 절반 가까이 시간이 지났다. 부시는 플로리다주정부 인증후 워싱턴에 사무실을 차려놓고 인수팀을 가동 중이기는 하나 국민들에게 안하무인격으로 비춰질 수 있다는 우려 때문에 그동안 본격적인 작업에는 나서지 못했다.

행정 전문가들은 정권 인수 작업의 지연으로 차기 행정부가 중대한 타격을 받게 될 것이란 우려를 나타냈다.

새 대통령이 확정되면 행정부의 각종 직책에 2,500명을 새로 임명하게 되며 이들에 대한 연방수사국(FBI)의 신원조회에만 2∼3주가 걸리는 것으로 알려져 있다. 정상적인 상황이라면 이미 내각 진용이 짜여져 새 대통령이 첫 의회연설에서 발표할 정책을 확정할 단계지만 아직 각료인선조차 확정짓지 못하고 있는 상태이다. 현재 콜린 파월 전 합참의장이 국무장관으로 내정돼 있고 콘돌리사 라이스 스탠포드대 교수가 안보담당 보좌관으로 결정돼 있는 상태이지만 다른 각료들은 아직 불투명해 이들의 선임과 신원조회에 박차를 가해야 하는 형편이다.